Você precisa personalizar as informações do seu CTe, basta acessar o Menu.
Clique em Transporte.
Clique em Personalizar campos CTe, no quadro laranja.
Verifique o que você deseja exibir no CTe.
Você pode deixar informações configuradas como CFOP, Natureza de Operação, Tipo de Serviço, Tomador do Serviço e alguma Observação.
Pronto agora é só salvar, e realizar a emissão do seu CTe.